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PCR實(shí)驗(yàn)到底需要哪些種類的酶

更新時(shí)間:2023-04-03 瀏覽次數(shù):1404

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的核苷酸片段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊核苷酸復(fù)制,PCR的最大特點(diǎn)是能將微量的核苷酸進(jìn)行大幅擴(kuò)增,從而達(dá)到容易鑒定和識(shí)別程度。

各種PCR到底需要哪些種類的酶?下面一起跟著遠(yuǎn)慕生物來了解一下。

DND聚合酶——又稱DNA依賴的DNA聚合酶

它是以DNA為模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一類酶。DNA聚合酶根據(jù)聚合酶活力特征和外切酶活性特征的不同,有可以分為多種。在IVD領(lǐng)域中比較常見的酶如下:

Taq DNA聚合酶——Taq DNA聚合酶是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的熱穩(wěn)定DNA聚合酶,分子量65kD,

從Thermus aquaticus中分離出來,是目前科研和分子診斷試劑盒里最為廣泛應(yīng)用的聚合酶。為了更優(yōu)化PCR反應(yīng)體系,Taq DNA 聚合酶被進(jìn)行了一系列的性能提升和優(yōu)化,其中最為熟知的就是熱啟動(dòng)Taq酶,該酶被進(jìn)行了化學(xué)修飾、抗體修飾或者配體修飾。無論是哪種修飾,其原理都是:在反應(yīng)體系加熱至高溫之前,Taq DNA 聚合酶活性被“修飾"抑制,進(jìn)而抑制低溫條件下的非特異性擴(kuò)增。另外,還有一系列突變體Taq DNA聚合酶被篩選出來以滿足耐鎂離子、耐鹽、高保真等要求。

Bst鏈置換DNA聚合酶——Bst DNA聚合酶是來源于 Bacillus stearothermophilus的DNA Polymerase I,經(jīng)基因工程改造去除了其 5’-3’核酸外切酶活性,但保留了 5’-3’ DNA 聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性。同時(shí),該酶在擴(kuò)增速度、產(chǎn)量、耐鹽性和熱穩(wěn)定性等方面均有大幅提高,而且增加了dUTP耐受性,非常適合于防污染的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如 LAMP 等。

由于此次新冠的影響,Bst成為IVD領(lǐng)域內(nèi)又一個(gè)DNA聚合酶寵兒。

Tth DNA聚合酶——Tth DNA聚合酶來自Thermus thermophilus HB8,其最有趣的現(xiàn)象是:在Mg2+條件下,Tth DNA聚合酶具有較強(qiáng)的DNA聚合酶活性。在Mn2+條件下,Tth DNA聚合酶具有更強(qiáng)的反轉(zhuǎn)錄活性。這一特性使得Tth DNA聚合酶搭配相應(yīng)的buffer可以同時(shí)對(duì)DNA模板和RNA模板進(jìn)行擴(kuò)增。

逆轉(zhuǎn)錄酶——又稱為RNA依賴的DNA 聚合酶

該酶以RNA為模板,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA (complementary DNA,CDNA)。最chang用的逆轉(zhuǎn)錄酶為M-MLV和AMV。

RNA聚合酶——一條DNA鏈或RNA為模板的聚合酶

也稱為轉(zhuǎn)錄酶。最為常見的是T7 RNA聚合酶,分子量約99kDa。專門催化5'→3'方向的RNA形成過程。目前體外診斷中, SAT技術(shù)中會(huì)看到RNA 聚合酶的身影。

實(shí)時(shí)熒光核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)技術(shù)(Simultaneous Amplification and Testing,簡(jiǎn)稱SAT)是將新一代的核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)和實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合的一種新型核酸檢測(cè)技術(shù)。該技術(shù)具有高靈敏度、高特異性、低污染、反應(yīng)穩(wěn)定等優(yōu)點(diǎn)。同一溫度下,首先通過M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶產(chǎn)生靶標(biāo)核酸(RNA)的一個(gè)雙鏈DNA拷貝,然后利用T7 RNA多聚酶從該DNA拷貝上產(chǎn)生多個(gè)(100~1000個(gè))RNA拷貝;每一個(gè)RNA拷貝再從反轉(zhuǎn)錄開始進(jìn)入下一個(gè)擴(kuò)增循環(huán);同時(shí),帶有熒光標(biāo)記的探針和這些RNA拷貝特異結(jié)合,產(chǎn)生熒光。該熒光信號(hào)可由熒光檢測(cè)儀器實(shí)時(shí)捕獲,實(shí)時(shí)反映擴(kuò)增循環(huán)情況。

蛋白酶K——能夠酶解樣本中的各類蛋白質(zhì)的酶

蛋白酶K是一種從白色念珠菌分離出來的強(qiáng)力蛋白溶解酶,具有很高的比活性,在較廣的pH范圍(4?12.5)內(nèi)及高溫 (50?70°C)下均有活性,EDTA等螯合劑或SDS等去垢劑均不能使之失活。用于質(zhì)?;蚧蚪MDNA、RNA的分離和抽提。在病毒核酸檢測(cè)中,蛋白酶K是病毒采樣液中的重要組分之一,蛋白酶K可以裂解病毒的外殼蛋白并使其失活,同時(shí)將病毒基因組釋放以便后續(xù)進(jìn)行核酸抽提。

當(dāng)然,除了以上提及的酶以外,還有其他各種各樣的酶被廣泛應(yīng)用。

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